平凡的大学生金木研因为遭到喰种猎食而性命垂危，某位医生为他进行了器官移植手术，但是器官提供者其实是猎食他的喰种。
在病床上醒来的金木研很快就感觉到身体不对劲，原本记忆中美味的食物全都恶心到难以下咽。
一开始，即使好几不吃东西他也不会饿，但不久，激烈的空腹感开始折磨他。
当他意识到，能引起他食欲的对象只剩下街上擦身而过的男男女女，他绝望的日子也就此开始……
在痛苦与挣扎的食人过程中金木的实力不断变强直至成长为了SSS级喰种，并在此过程中逐渐收获了属于喰种一方的友情与事业。
但可惜好景不长，金木研在后续某次CCG搜查官的喰种围剿行动中不幸被俘，并且因为在之前的战斗中被CCG最强特等搜查官有马贵将的库因克捅进大脑这种物理性原因而丧失了一部分记忆，之后更是被CCG方面通过特殊技术塑造了一个新的搜查官人格，并化名为佐佐木琲世。
刚成为CCG三等搜查官的佐佐木琲世，一直跟随真户晓学习一等搜查官的搜查技术。
两年后，佐佐木已已经可以独当一面并成为一等搜查官，但却因为某次任务需求而逐渐觉醒了女装的爱好，平时是“昆克斯班（独眼喰种搜查官队）”的指导者，带领着四名下属（半喰种）进行各种搜查工作。
之后，佐佐木琲世在讨伐月山集团时觉醒了属于金木研的记忆与力量，击败了独眼枭，成为准特等搜查官，并离开昆克斯班，加入有马班。
再之后，彻底恢复金木研身份的佐佐木琲世为了救出被关在库克利亚的雏实，只身面对“不败的搜查官”，击败有马贵将后创立了新的喰种集团“黑山羊”，并成为了新的“独眼之王”。
在“黑山羊”被歼灭后，由于其理念作为影响“黑山羊”和CCG时期的同僚，进而促成CCG和“黑山羊”组成联合作战的同盟“共同战线”对抗主谋“V”组织和“丑”。
金木研则前往位于地底的巨大迷宫“24区”独自面对和修之龙，亲自终结“V”组织和“丑”的阴谋。
“龙战”落幕的六年后，CCG东京分部重新组织为“TCG（东京保安委员会TokyoSecurityCommittee）”。
昔日CCG成员和“黑山羊”组成联合作战的同盟“共同战线”，成为促进人类和喰种平等共处合作的核心组织。
金木研为持续实践人类和喰种平等共处的理念，担任“共同战线”的协助者……】
“东京喰种？食尸鬼？第一个祈愿任务是食人鬼，第二个祈愿任务是食尸鬼？总感觉站点抓取的这些祈愿世界似乎对我（的尸体）充满了某种无法言的恶意与欲望。”