与此同时，崇祯帝下令拆毁各地为魏忠贤建造的祠堂，这项工程预计比建造生祠花费还要大！因为东林君子们要彻底清除阉党余毒。有一个成语叫做势在必行、在所不惜！
皇帝还规定宫中内监不得擅自出京，并要求各地镇守的太监立即办理移交手续，火速返回京城。至于东厂、锦衣卫那真正是可有可无啊，有东林君子们足矣！这个英武神明的皇帝宁愿自己变成聋子瞎子也不能让家奴恶了东林君子！
在定阉党逆案的同时，崇祯帝逐步展开平反昭雪活动，为一些受阉党迫害的东林党人恢复名誉。可惜这个时候没有国家赔偿概念，不然东林君子们一定会高呼圣君！
从理论上讲，褒扬正义，铲除邪恶，崇祯帝都一一做到了。除恶扬善，求的是上下齐心，一心向善。然而，理论用之实践的结果却让崇祯帝品尝到了政 治的苦涩。
阉党和东林党的斗争由来已久，用清初士人的话来说，东林未必都君子，而阉党未必皆小人也，所谓的清除邪恶一方，褒扬良善一方也只能是相对而已。两党之间的明争暗斗一直持续到清朝统治初年，一心整饬朝纲的崇祯帝陷入了一场永无休止的战争之中。
明朝自万历以来，党争不断，东林与宣党、昆党、齐党、楚党、浙党之间互相攻击，终于导致天启年间阉党专政的局面。朱由检即位之后的首要举措就是清算阉党， 但这只能说是第一步，进一步消除党争是更加令人头疼的大事。他到死也没能取得什么进展。
朝堂上诸公不干人事，皇帝想做也做不了的结果就是地方上没人管，袁崇焕敢跑到皮岛杀人就是在这种背景下发生的。而袁崇焕拆散东江则去除了后金的一块大石头，于是乎大明就悲剧了。
崇祯二年十月，“抗金名将”袁崇焕逼走跋扈总兵毛文龙之后三个月，后金主黄台吉举兵数十万绕过大明花费几千万两白银打造的关宁防线分别进入龙井关、大安口。
要说百十号人绕过十几万人驻守的关宁防线不是难事，难的是十几万人，还是骑兵，一人几匹马不好说，但一人一匹马是肯定有，那烟尘估计几里外也能看见。
有人说后金人可以绕道蒙古，关宁军肯定发现不了。有趣的是这个时候蒙古左翼是林丹汗做主，他虽然对大明也不太友好，却是将女真人当做死敌的。十几万人想要经过他的地盘不分出个输赢他如何面对其他的蒙古部落？而我们的袁巡抚在此之前为了拉拢蒙古诸部落可是将关宁军的口粮都卖给了蒙古安达的！闹得差点关宁军就断粮。
不说黄台吉是如何躲过林丹汗又躲过袁崇焕绕道关宁军后面去的。光说袁崇焕接下来的应对。他听闻消息后率领祖大寿、何可刚入关守卫，所经过的蓟州、抚宁、永平、迁安、丰润、玉田各城，都分兵留守。皇帝朱由检得知后非常高兴，下令嘉奖袁崇焕的部下，并让袁崇焕统领指挥各地援军。