佛、道、儒三教之争也因为这种气度而缓解，李世民对于佛、道、儒三教没有什么偏袒，秉着只要你们不惹事，就不介意他们在大唐传教的心态。
可是程咬金听到大家说到佛家的危害后，理所当然的认为既然佛教不好，干嘛还要让他在大唐生存？干嘛还要让它继续祸害大唐？
他这一番言论，恰好打破了这种和平的姿态。
孔颖达、虞世南、魏征、褚亮、于志宁、张玄素这些正统的儒士，本就对佛教有着心灵深处的鄙夷，有了程咬金开头，一干人立刻展开了潮水般的攻势，三言两语将佛教贬低得一无是处、一文不值。
但是朝中佛教信徒也大有人在，他们以萧瑀为首，言辞犀利的展开还击。
刹那之间，全新的儒佛之争，在朝堂上有着越演越烈的架势。
至于房玄龄、长孙无忌则不发表意见。二人都出生于书香门第，是正统的儒家弟子。然他们并未有儒家学子的死板，懂得变通。他们都是当世人杰，在处理政务的时候，早已发觉寻常的儒家知识根本不足以处理天下事务，于是灵活变通的打着儒家的旗号，以法家的手段来处理。对于这场突如其来的儒佛之争，抱以中立的态度。
李世民有着同样的想法，比起寻常的帝王他的思想要开明的多。他并不像秦皇汉武一般，以学说来禁锢思想，达到控制百姓的目的，这也是他能够接受柴令武各种稀奇古怪却非常行之有效的主张的原因，也因如此，大唐才有这瞩目璀璨的文化风气。
但是经过柴令武分析出派遣僧侣去祸害异族的因由后，知道了佛教发展到一定的程度后，将会一个强盛的国家拖垮，更因为有着南朝萧衍之故，对于佛教生出了警惕之心。
他不信佛，但是谁敢保证以后会不会有个信佛的子孙当皇帝，若是像萧衍那样上演四度出家，这大唐也玩得玩完了。
“圣上，佛家理念都是诓骗百姓的无稽之谈。里面教唆世人斩断七情六欲，四大皆空，但真是可笑至极。臣见过一个美满家庭，因为信佛而家破人亡。此人早年文采飞扬，是数一数二的才子，家人望他光宗耀祖。母亲日夜操劳供他念书，妻子下田务农养活生计，只盼丈夫能够给家庭改头换面。可丈夫受到了和尚的蛊惑出家为僧，摒弃尘缘一切。结果老人气死家中。那混账竟然理也不理。妻子带着不满两个小小的孩子沿街乞讨，去往寺庙求见一面。丈夫却依旧避而不见，口口声声说已经斩断一切情缘，愿终身侍佛左右。如此行径那与畜生又有何意义？”
魏征要灭佛并没有私心，完全是个人见解。在他看来佛教的许多东西都是虚无缥缈的，尤其是所谓的轮回之说，更是无稽之谈，一言一论都是诓骗百姓的论点。属于邪魔歪道的范围，对于这种邪魔歪道，就应当斩尽杀绝。
而他所说的案例确有其事，而且还不少，所以他对于佛家厌恶至极。在他看来佛家的理论，已经让一个人摒弃了孝义的人伦之常，等同畜生一样。
“以上之例，乃是出于一个个普通家庭。从天下言信佛者需出家避世，一但此教广而传开，各地兴建寺庙，百姓信教出家，便会占用大量土地，平白折损无数劳动力。”
“北魏太武帝禁佛之前，仅洛阳就有寺院就有十千四百余所左右，僧尼数万人。这些僧尼不劳而获，靠着别人供养而养尊处优，北周武帝宇文邕禁佛时，境内有佛寺三万余所，僧尼人数二百万之众，宇文邕征服北齐后坚持禁佛，仅北齐旧地的佛寺超过4万所，僧尼数量超过300万。”
“僧尼可以免除徭役、兵役，但却需要其他人供养。换句话说，佛家的和尚不仅不能创造财富，还在吸食着天下的精华。他们为了稳固地获得供养，寺院就要占有大量农田和房产，而且出家人都是成年人，孩子、父母谁来养？一个国家三百余万的人天经地义地不劳而获，势必大大影响国家财政，几百万人出家还会严重影响人口增长。”
“如其心怀不轨圈地自治，更为一大害。佛家理论善于掌控人心，能够让信徒六亲不认，如果僧人领袖有谋反之心，他只需挥臂高呼，天下信徒必定一呼百应，而且还是不要命的那种。”